Mookait gehört zu der Jaspis - Familie und zählt damit zu den mikrokristallinen Quarzen und zur Mineralklasse der Oxide. Seine Farben entstehen durch Fremdstoffeinlagerungen. Eisenhydroxid - Verbindungen verursachen die gelblichen Tönungen , Eisenoxid - Verbindungen die rötlichen . Die weißen Bereiche des Mookaits sind eisenfrei. Je nach Gehalt und Art der Eisenoxid - Verbindung zeigt Mookait ineinander verlaufende Bereiche von weißer, beige-gelber, ockerfarbener und roter Farbe, deren Farbton meist pastellig bis hell sind.
Mookait entsteht sekundär aus Kieselsäure - Lösungen, die durch Verwitterungsprozesse aus silikathaltigem Gestein freigesetzt werden und mit Sickerwasser ins Sedimentgestein eindringen. Auf diese Weise enstehen ausschließlich in Australien große Mengen von Mookait.